台江鯨豚館於2005年4月8日揭牌開幕，臺南市政府亦利用原南寮鹽村舊鹽民活動中心整修作為標本的暫時存放處所。此處展出國立成功大學生物系王建平教授製作全國最大的鯨魚標本，館內除巨型抹香鯨骨骼標本外，亦加裝小虎鯨、小鬚鯨及島久鯨(新種)等懸吊式標本，同時配合掛圖說明，以利教育及導覽解說使用。